Bộ trưởng Viễn Thông và Tin Học Yeo Cheow Tong của Singapore nói việc điều tra rất khó khăn, vì chiếc phi cơ bị phá hủy hoàn toàn. Ủy Ban An Toàn của Indonesia cho biết không có bằng chứng để giải thich nguyên nhân tai nạn.
Theo phúc trình không chính thức của đoàn điều tra Indonesia, đã có sự can thiệp trái phép trong vụ này, làm phát sinh những đồn đoán rằng phi công có ý định tự sát, nhưng báo cáo sau cùng nói là không thấy có vấn đề gì ở phi hành đoàn. Chính quyền Singapore trong thông cáo sáng Thứ 5 cho biết các nhà điều tra đã không bỏ qua một chi tiết nào mà không thể xác định được điều gì.
Theo cơ quan An Toàn Chuyên Chở Hoa Kỳ, phi công Tsu Way Ming, từng là phi công biểu diễn nhào lộn, đang bị nợ nần trầm trọng sau 8 năm mua bán chứng khoán và có những rắc rối về vấn đề kỉ luật với công ty hàng không Singapore.
Văn thư của chủ tịch cơ quan này, gửi cơ quan An Toàn Hàng không Indonesia, cho biết không có khiếm khuyết nào ở chiếc Boeing 737, tai nạn chỉ có thể được giải thich là chủ tâm của phi công.