Theo báo Tiền Phong, gần 20 năm nay, chùa Vân Hồ tại TP Hà Nội lâm vào "cơn bão đơn từ" nhằm đòi lại đất trong khuôn viên chùa bị 1 gia đình cư dân chiếm dụng, nhưng vẫn bó tay. Báo Tiền Phong ghi nhận diễn tiến vụ việc như sau. Từ năm 2000<"xml:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" />
Từ năm 2000, Sở Địa chính-Nhà đất Hà Nội đã khẳng định nguồn gốc và việc sử dụng đất chùa Vân Hồ: "...vị trí tại 40 phố Lê Đại Hành, quận Hai Bà Trưng..., có diện tích 2 ngàn 210m2 do chùa sử dụng. Đứng tên chủ sở hữu: Thành phố Hà Nội, đăng ký năm 1939 kèm theo bản đồ đăng ký năm 1956". Ngày 17/8/1992, UB thành phố HN có giấy phép sử dụng đất cấp cho Sở Văn hóa Thông tin hợp thức hóa quản lý đất di tích chùa Vân Hồ, diện tích 2 ngàn165m2 trong khuôn viên tường gạch bao quanh và có điều kiện phải di chuyển hộ dân ở nhờ ra khỏi khu vực di tích.
Trong khi đó, ông Trần Văn Lụa, quê xã Đỗ Động, huyện Thanh Oai, Hà Tây được sư cụ trụ trì chùa Vân Hồ từ là Thích Đàm Tỵ cho ở nhờ phần đất trong khuôn viên, phía sau chùa, giáp đường Bà Triệu.Tại đây, ông Lụa dựng nhà tạm để ở và vào hộ khẩu ngày 5/10/1955 mang số nhà 312 Bà Triệu, quận Hai Bà Trưng. Năm 1985, ông Lụa cũng kê khai đăng ký nhà tư nhân với xí nghiệp quản lý nhà Q. Hai Bà Trưng, tổng diện tích 37.7m2, lý do: ở nhờ nhà chùa.Vậy là quá rõ ràng, nhưng trình tự giải quyết di chuyển hộ gia đình ông Trần Văn Lụa ra khỏi di tích chùa Vân Hồ sao vẫn khúc mắc" Nhà chùa bắt đầu khiếu nại năm 1989.
Từ năm 1990 đến năm 2000 có tới hơn 30 văn bản của Văn phòng Chính phủ, Tổ công tác của Thủ tướng Chính phủ, Bộ VHTT, UB thành phố HN, Ban quản lý di tích-danh thắng HN, UB Quận Hai Bà Trưng, phường Lê Đại Hành, và từ 2000 lại đây tiếp tục hàng chục "thư đi tin lại" nhưng chùa vẫn bị "tạm chiếm".
Gần đây nhất, ngay cả khi UB thành phố Hà Nội chấp thuận phương án đền bù thiệt hại cho gia đình ông Lụa khi thành phố thu hồi đất trả lại chùa (1/2003), ông này không rời nửa bước. Không chỉ thế, đến tháng 7/1997, ông Lụa lại lấn chiếm và xây trái phép với diện tích mở rộng thành 72m2.
Báo Tiền Phong ghi nhận rằng khi phóng viên thăm chùa chiều 6/5/2006, thấy ngôi chùa vẫn khang trang sạch đẹp nhờ bàn tay chăm sóc của các nhà sư. Sư trụ trì-Tỷ Khiêu Thích Đàm Hợp năm nay đã ngoài 80, cụ vừa mổ mắt về nên sức khoẻ suy giảm. Cụ nói: Còn sống ngày nào, tôi giữ chùa tới ngày đó. Không thể kể hết số đơn mà sư Thích Đàm Hợp và tăng ni Phật tử bốn phương gửi đi khắp các cơ quan công quyền và công luận.
Cũng theo báo Tiền Phong, trên địa bàn Quận Hai Bà Trưng có 8 ngôi chùa lớn như chùa Vua, Hộ Quốc, Vân Hồ, Quang Hoa, Chân Tiên, Hương Tuyết, Hoà Mã và Liên Phái. Tất cả đều từng có ít nhất 4 gia đình dân sinh sống trong khu vực I, đã và đang được di dời thành công.
Báo TP viết tiếp: "Riêng chùa Vân Hồ, chỉ 1 hộ gia đình thôi mà sao quá gian nan" Ai đã lờ đi các quyết định của Bộ Văn hóa Thông tin, của UB thành phố HN cùng những văn bản chỉ đạo của tổ công tác Chính phủ, Văn phòng Chính phủ để ngang nhiên vi phạm Luật Di sản văn hoá""