Phùng Khắc Khoan hiệu Nghị Trai, tự Hoàng Phu, quê ở làng Bùng, huyện Thạch Thất, Hà Tây (nay Hà Nội). Nên sau khi đỗ đạt người ta gọi ông là Trạng Bùng.