Các vụ bom nổ, gồm cả một vụ bên ngoài Thánh Đường Công Giáo chính tại Jakarta gần Dinh Tổng Thống và đền thờ Hồi Giáo chính, xảy ra khi thánh lễ sắp thực hiện trong đêm theo giờ địa phương. Nhiều xe bốc cháy và thiệt hại nhiều nhà thờ.
“Đây là hành vi khủng bố người Công Giáo trong đêm trước Giáng Sinh,” theo lời Thanh Tra Cao Cấp của cảnh sát Supono (nhiều người Indonesia chỉ dùng 1 chữ làm tên).
Chưa có tổ chức naò nhận trách nhiệm. Mặc dù hầu hết các vụ bạo động xảy ra trên đảo Moluccan, các nhóm cực đoan Hồi Giaó gần đây có tấn công các tiệm ăn và hộp đêm ở thủ đô Jakarta. Tổng Thống Abdurrahman Wahid, tự thân là một học giả Hồi Giáo, đã luôn luôn kêu gọi khoan dung tôn giáo, nhưng các màn tấn công hôm nay đã cộng thêm vào danh sách dài những cuộc khủng hoảng và hành vi bạo lực vốn tệ hại thêm trong 14 tháng cầm quyền của ông.
Có 5 nhà thờ Công Giaó và Tin Lành bị bom ở Jakarta, nơi đó 3 người chết. Các quả bom ở Jakarta nổ trong vòng 1 giờ, và cách nhau trong đường kính một dặm. Quả bom nổ gần Thánh Đường Công Giaó chính được suy đoán là gài trong một xe hơi đang đậu. Một quả bom chưa nổ cũng được khám phá gần thánh đường, nơi hàng trăm Ky Tô Hữu đang tới trước thánh lễ Giáng Sinh, trong khi hàng ngàn tín đồ Hồi Giaó đang rời một đền thờ gần đó sau lễ kinh cầu ban đêm của Hồi Giáo. Các nhà thờ khác đã di tản sau khi nhận được lời hăm dọa.
Có 4 tiếng nổ bên ngoài một nhà thờ vùng ngoại ô Menteng, theo lời cảnh sát. Ở phía Đông Jakarta, một người chết trong một vụ bom nổ tại trạm xe búyt bên ngoài một nhà thờ, theo lời Supono. Trong số người chết hôm Chủ Nhật có tới 4 người là cảnh sát khi tìm cách gỡ bom tại Pekanbaru trên đảo Sumatra, theo tin hãng Antara. Một thường dân cũng chết vụ này.
Trên đảo Batam, kế cận nước láng giềng Singapore, có 3 vụ bom nổ gây bị thương 22 người. Các vụ nổ làm rung chuyển 3 nhà thờ tại thị trấn Mojokerto, phía Đông Java. Bom cũng nổ gần 2 nhà thờ ở thị trấn Mataram, trên đảo du lịch Lombok.
Tín đồ Ky Tô Giáo chiếm chưa tới 5% trên tổng dân số 210 triệu người Indonesia. Nhiều người là thuộc cộng đồng thiểu số gốc Hoa, vẫn cứ bị quấy phá bởi các nhóm Hồi Giaó cực đoan gần đây.