Cơ quan FBI tin rằng 5 hoặc 6 người chủ mưu đang tại đào ở Hoa Kỳ, Âu Châu và Trung Đông. Ít nhất 4 âm mưu tấn công cơ sở Hoa Kỳ đã bị phá vỡ, gồm Toà Đại Sứ Hoa Kỳ tại Paris, 1 toà nhà của Hoa Kỳ ở Thổ Nhĩ Kỳ, các cơ sở của sứ quán Mỹ ở Yemen, và cao ốc của NATO ở Brussels.
Các viên chức Hoa Kỳ cho biết đa số các bằng chứng không chỉ rõ các mục tiêu bị tấn công, nhưng cho hiểu rằng các tổ khủng bố đang rình chờ cơ hội tấn công. FBI nhắc lại rằng trong Tháng 12-1999, CIA và các cơ qan tình báo Hoa Kỳ đã ngăn chận được từ 5 đến 15 trận tấn công khủng bố nhân dịp mừng Thiên Niên Kỉ mới, mà trong số các mục tiêu gồm phi trường Los Angeles và 1 khach sạn đông khach Mỹ ở Jordan.
FBI cho biết đang săn tìm ông Khaled Alzeedi, một phi công Saudi Arabia đã mua 2 phi cơ nhỏ ở Tennessee, và rời khỏi tiểu bang này 1 thời gian ngắn trước biến cố 11-9. Alzeedi có tên trong danh sách những người FBI tìm bắt để điều tra.